43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6414 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6218  polysaccharide biosynthesis protein  78.49 
 
 
502 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145778  normal  0.14041 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
502 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4810  polysaccharide biosynthesis protein  63.43 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  52.58 
 
 
860 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  38.44 
 
 
495 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1326  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0633  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3025  polysaccharide biosynthesis protein  29.71 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117283  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
416 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
416 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
416 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
416 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
416 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
416 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  24.16 
 
 
416 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  24.16 
 
 
416 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
416 aa  63.9  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0169  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 
423 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0209  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
417 aa  60.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 
477 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4137  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4206  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
416 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4255  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
416 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4314  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
416 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.870707  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4152  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
416 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0589489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00202  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
417 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0164  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  20.43 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
422 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.69 
 
 
493 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>