37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0520 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  76.92 
 
 		 416 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  76.92 
 
 		 416 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  76.2 
 
 		 416 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  99.52 
 
 		 418 aa  828    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  99.52 
 
 		 418 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 418 aa  832    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0169  polysaccharide biosynthesis protein  84.58 
 
 		 416 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 		 416 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  74.76 
 
 		 416 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  74.76 
 
 		 416 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 		 416 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 		 416 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  74.76 
 
 		 416 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 		 416 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  74.76 
 
 		 416 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  74.04 
 
 		 416 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4255  polysaccharide biosynthesis protein  74.76 
 
 		 416 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4137  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 		 416 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4314  polysaccharide biosynthesis protein  74.76 
 
 		 416 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.870707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4206  polysaccharide biosynthesis protein  74.28 
 
 		 416 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4152  polysaccharide biosynthesis protein  74.76 
 
 		 416 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0589489  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0164  polysaccharide biosynthesis protein  62.26 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0209  polysaccharide biosynthesis protein  57.35 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  33.08 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1326  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 		 422 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00202  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3025  polysaccharide biosynthesis protein  31.39 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117283  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  29.59 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0633  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  23.47 
 
 		 860 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4810  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  23.2 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6218  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145778  normal  0.14041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>