38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1326 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1326  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 422 aa  846    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  72.37 
 
 		 414 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0633  polysaccharide biosynthesis protein  44.44 
 
 		 415 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  33.75 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3025  polysaccharide biosynthesis protein  36.54 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117283  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00202  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.09 
 
 		 417 aa  239  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  33.08 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.95 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  32.51 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0169  polysaccharide biosynthesis protein  31.77 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  31.42 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  31.42 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  31.42 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 		 416 aa  200  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  30.92 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4152  polysaccharide biosynthesis protein  31.6 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0589489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4137  polysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4314  polysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 416 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.870707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4255  polysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 416 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4206  polysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0209  polysaccharide biosynthesis protein  32.64 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0164  polysaccharide biosynthesis protein  30.02 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  23.88 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 495 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4810  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6218  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145778  normal  0.14041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  21.97 
 
 		 860 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>