50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6218 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6218  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 502 aa  984    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145778  normal  0.14041 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  78.49 
 
 		 502 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4810  polysaccharide biosynthesis protein  61.94 
 
 		 502 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  52.16 
 
 		 860 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  39.64 
 
 		 495 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0633  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3025  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 416 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117283  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1326  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0169  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  22.62 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  22.62 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0209  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 417 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4137  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 416 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4255  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  21.19 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4206  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4314  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.870707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4152  polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 		 416 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0589489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.83 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2750  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0164  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.83 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.83 
 
 		 510 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  21.79 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.49 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 492 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 496 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>