37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3996 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  84.86 
 
 
416 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  85.1 
 
 
416 aa  706    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  83.89 
 
 
416 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4314  polysaccharide biosynthesis protein  85.82 
 
 
416 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.870707  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4152  polysaccharide biosynthesis protein  85.82 
 
 
416 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0589489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4137  polysaccharide biosynthesis protein  85.82 
 
 
416 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4255  polysaccharide biosynthesis protein  85.82 
 
 
416 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4206  polysaccharide biosynthesis protein  85.34 
 
 
416 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  84.86 
 
 
416 aa  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  84.38 
 
 
416 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  84.86 
 
 
416 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0169  polysaccharide biosynthesis protein  77.59 
 
 
416 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  85.1 
 
 
416 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  84.86 
 
 
416 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  85.1 
 
 
416 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
416 aa  818    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  76.2 
 
 
418 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  76.2 
 
 
418 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  75.96 
 
 
418 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  72.36 
 
 
416 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  71.88 
 
 
416 aa  591  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0164  polysaccharide biosynthesis protein  62.98 
 
 
416 aa  471  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0209  polysaccharide biosynthesis protein  57.83 
 
 
417 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1326  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 
422 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  30.92 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00202  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.6 
 
 
417 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 
428 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.512575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1305  polysaccharide biosynthesis protein  28.46 
 
 
417 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.899512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3025  polysaccharide biosynthesis protein  31.59 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.117283  normal  0.177019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0633  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 
415 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  24.2 
 
 
860 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4810  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
502 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
502 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2507  membrane protein  20.52 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6218  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
502 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145778  normal  0.14041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>