158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0665 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
426 aa  852    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  44.23 
 
 
446 aa  353  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  45.15 
 
 
449 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  42.07 
 
 
440 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  43.03 
 
 
440 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  41.71 
 
 
444 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  39.66 
 
 
444 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  39.81 
 
 
444 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  36.94 
 
 
451 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  38.69 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  36.28 
 
 
441 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  33.88 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  36.7 
 
 
448 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 
436 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  31.48 
 
 
449 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  31.59 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 
429 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  28.35 
 
 
477 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
478 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
511 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.34 
 
 
476 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.51 
 
 
483 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
435 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
473 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
486 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  24.56 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.4 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.15 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  23.39 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  23.65 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  22 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  20.12 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  22.88 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
482 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  25.3 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  21.16 
 
 
422 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
488 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  25.26 
 
 
456 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  20.12 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  20.49 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  19.7 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 
418 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  19.52 
 
 
418 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
526 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
488 aa  60.1  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  18.02 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  18.62 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  18.62 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
546 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
512 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  18.62 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  18.62 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  18.62 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  18.62 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  18.62 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
413 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
542 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 
471 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.76 
 
 
517 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  25.21 
 
 
506 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4207  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00266621  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  23.88 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
475 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
506 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
477 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
503 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  25.66 
 
 
475 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  25.66 
 
 
474 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
529 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
547 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  23.27 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3189  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 
453 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  21.54 
 
 
467 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
483 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>