137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1766 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 441 aa  853    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  41 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  40.61 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  36.28 
 
 		 426 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  34.65 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  36.82 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  36.99 
 
 		 482 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  34.46 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  35.78 
 
 		 444 aa  232  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  31.35 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  36.04 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  31.17 
 
 		 449 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  31.89 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  28.94 
 
 		 429 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 486 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  27.42 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  26.53 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  25.26 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  24.28 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  25.58 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 542 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.89 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  25.14 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  25.14 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  31.71 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  19.65 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.76 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  30.39 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.25 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 523 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.94 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  25.26 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.65 
 
 		 495 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 493 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 546 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  30.33 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 541 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 485 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  22.43 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  24.32 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 474 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.5 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  20 
 
 		 456 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  21.61 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  19.76 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  24.73 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  27.47 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  20.54 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  30.18 
 
 		 496 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 483 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  30.23 
 
 		 498 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>