40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0771 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  79.9 
 
 		 420 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  99.28 
 
 		 418 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  94 
 
 		 418 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  94.96 
 
 		 418 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  94.98 
 
 		 418 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  94.72 
 
 		 418 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  100 
 
 		 418 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  94.72 
 
 		 418 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  79.86 
 
 		 420 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  79.38 
 
 		 420 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  79.95 
 
 		 444 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  80.67 
 
 		 419 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  80.67 
 
 		 444 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  80.67 
 
 		 444 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  80.67 
 
 		 444 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  80.67 
 
 		 444 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  80.67 
 
 		 444 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  80.67 
 
 		 444 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  34.2 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  32.28 
 
 		 416 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  28.74 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2278  PST family polysaccharide export protein  82.76 
 
 		 67 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.608743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 449 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>