165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1959 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 451 aa  909    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  43.81 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  42.04 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  41.67 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  36.38 
 
 		 444 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  36.94 
 
 		 426 aa  295  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  37.32 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  34.15 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  39.7 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  34.81 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  32.93 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  35.14 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  34.09 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  29.71 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.39 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  22.3 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  24.64 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  22.85 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  21.81 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 499 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  25.22 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  24.94 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  29 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  23.38 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  23.38 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  23.38 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  23.38 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  23.38 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  23.38 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  23.54 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  22.6 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  21.26 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  23.21 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 489 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 489 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.82 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  21.85 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4207  polysaccharide biosynthesis protein  20.86 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00266621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 493 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  26.7 
 
 		 470 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  26.47 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  19.94 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  25.35 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>