156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3041 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 471 aa  933    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  44.97 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  37.76 
 
 		 485 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  39.39 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  34.77 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  36.53 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  35.81 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  35.1 
 
 		 475 aa  256  7e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  35.95 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  34.34 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  35.95 
 
 		 474 aa  226  9e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  29.54 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  29.54 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  28.82 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  25.27 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.11 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  23.59 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 433 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  26.14 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.84 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  26.14 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  25.92 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  22.17 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  22.17 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  22.17 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  22.17 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  22.17 
 
 		 422 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 418 aa  94  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  21.62 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 419 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  22.17 
 
 		 422 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  22.17 
 
 		 422 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 484 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 417 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 417 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 417 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  20.6 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  22.77 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.71 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.87 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.33 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  22.25 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  19.89 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 542 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 440 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>