127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2965 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 500 aa  976    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  97.8 
 
 		 500 aa  858    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 448 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  39.4 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  40.36 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 		 458 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  38.21 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  38.02 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  33.17 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  29.25 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  31.14 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.3 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  28.12 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 507 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 503 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 497 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  25.27 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.16 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  21.88 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.57 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.35 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  25.49 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.4 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.51 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  29.18 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 477 aa  67  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.53 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.94 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.65 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.06 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.65 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.19 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.19 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.06 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.19 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.19 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.19 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  23.97 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  18.02 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 504 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.06 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  23.1 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>