78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2913 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  80.57 
 
 		 458 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 458 aa  904    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  80.13 
 
 		 458 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  79.69 
 
 		 458 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  36.18 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  33.1 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  31.76 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.04 
 
 		 508 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 498 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 490 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  25.09 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.66 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 509 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  23.71 
 
 		 501 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.33 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.71 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  23.93 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  24.1 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 502 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 508 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.31 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  20.85 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5889  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  23.01 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  19.7 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  21.13 
 
 		 492 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  21.13 
 
 		 492 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>