57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2587 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 508 aa  988    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.02 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.17 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  21.98 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.06 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  31.91 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  19.22 
 
 		 483 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.07 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.97 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.97 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.97 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 502 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.97 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.97 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.89 
 
 		 508 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 511 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.77 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  20.71 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  20.95 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  21.09 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  20.95 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.68 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  21.19 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 418 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 418 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.31 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 503 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 492 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>