135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1714 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 483 aa  943    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  51.37 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  45.05 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  40.43 
 
 		 465 aa  292  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  32.6 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  32.59 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5253  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.95 
 
 		 486 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28.63 
 
 		 486 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4786  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.76 
 
 		 486 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2088  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.55 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 360 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.07 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0676  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  27.88 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 496 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.76 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.19 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  30.77 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2076  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.48 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 483 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.45 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4652  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.22 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541983  normal  0.0587271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  32.18 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  28.03 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.43 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4624  hypothetical protein  24.08 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187881 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  23.52 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  32.64 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1766  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  27.89 
 
 		 479 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.239762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 426 aa  57  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.37 
 
 		 490 aa  57  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2587  polysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  26.87 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  24.14 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 		 526 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 459 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 512 aa  53.9  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.47 
 
 		 517 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.64 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 504 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 511 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 507 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.45 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.4 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  32.11 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  52.17 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.86 
 
 		 518 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  20.43 
 
 		 485 aa  46.6  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 502 aa  46.6  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>