105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2996 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 459 aa  888    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  40.18 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  39.14 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  37.95 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  35.87 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  40.44 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  39.26 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  37.05 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  38.02 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  39.61 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  35.46 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  36.48 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  36.12 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  33.42 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  33.89 
 
 		 458 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  33.99 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  34.31 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  38.21 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  37.37 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 		 494 aa  93.2  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  28.06 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  24.59 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.6 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.89 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  25.06 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  24.22 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  25.91 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  21.45 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  31.15 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  40.18 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  25.39 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.12 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3178  polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.480735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.77 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 464 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 470 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.38 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 514 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  20.47 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4028  polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  28.77 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  29.44 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>