51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2006 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 529 aa  1008    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  35.33 
 
 		 495 aa  213  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 489 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.25 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  26.62 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.4 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  26.92 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  31.32 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  26.14 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  32.48 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2235  hypothetical protein  26.49 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.784831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  25.66 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  19.6 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 475 aa  54.7  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 135 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 536 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2768  membrane export protein  21.02 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  35.16 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 583 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 500 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  24.1 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>