89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1862 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  100 
 
 		 496 aa  968    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  58.38 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  47.25 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  52.36 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  47.45 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  44.74 
 
 		 494 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  46.26 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 		 447 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 499 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.42 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  26.71 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  26.65 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 474 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  26.9 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  39 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.1 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  25.79 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 474 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 		 423 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0133  hypothetical protein  22.27 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0569803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  32.02 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  34.72 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  34.45 
 
 		 135 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  30.97 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 478 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  19.34 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 547 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 423 aa  47  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2426  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  27.68 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.67 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  21.57 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 522 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>