62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5559 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 442 aa  815    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  78.25 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  59.52 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  60.67 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  60 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  55.92 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  38 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  37.77 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  35.76 
 
 		 468 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  36.6 
 
 		 490 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  39.05 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 		 460 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 456 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  37.77 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  37.8 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  37.06 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  36.81 
 
 		 459 aa  213  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  36.23 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 539 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  32.2 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.1 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  34.04 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  30.43 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  24.66 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  23.73 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 529 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  31.78 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  23.91 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 135 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 512 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  29.05 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  32.17 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  30.54 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0098  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.48 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>