28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1004 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  100 
 
 		 450 aa  889    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  80.89 
 
 		 450 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  74.1 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 458 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 456 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  21.91 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 458 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 539 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 499 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>