74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2754 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
460 aa  914    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  91.7 
 
 
458 aa  802    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  79.78 
 
 
456 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  78.24 
 
 
456 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  74.07 
 
 
455 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  77.38 
 
 
453 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  77.39 
 
 
458 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  36.02 
 
 
490 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  38.34 
 
 
474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  37.95 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  35.68 
 
 
474 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 
471 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  34.79 
 
 
468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  36.24 
 
 
467 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  34.79 
 
 
446 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  34.22 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  32.66 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  36.83 
 
 
442 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  32.71 
 
 
458 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  35.17 
 
 
445 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
453 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 
512 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 
407 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
539 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
489 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.01 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  27.59 
 
 
495 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  25.9 
 
 
450 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  24.01 
 
 
520 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  23.38 
 
 
496 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 
547 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
546 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 
495 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  24.04 
 
 
450 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 
483 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.96 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 
514 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
484 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  32.76 
 
 
135 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
456 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 
470 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  24.42 
 
 
435 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  22.09 
 
 
489 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  24.64 
 
 
436 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.1 
 
 
490 aa  50.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  23.26 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  27.92 
 
 
523 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  20.89 
 
 
520 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
482 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.6 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
444 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  25.17 
 
 
522 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
475 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
442 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 
464 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
479 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>