57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0987 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  97.16 
 
 		 458 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 458 aa  857    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  90.83 
 
 		 458 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  62.59 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  60.11 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  59.29 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 474 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  34.94 
 
 		 490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  35.1 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  32.43 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  35.22 
 
 		 474 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  35.05 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  32.48 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  34.42 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  31.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  34.06 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  33.89 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  35.03 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  34.65 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28.98 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30.9 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  26.95 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.49 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  31.82 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  25.65 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 512 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  28.9 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  31.76 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 536 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>