49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001317 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  100 
 
 		 435 aa  864    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  64.6 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  32.94 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 461 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 495 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  36.87 
 
 		 407 aa  90.1  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  46.46 
 
 		 135 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  24.63 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  25.63 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  30.82 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 498 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.75 
 
 		 517 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 539 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  26.45 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 512 aa  50.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  32.71 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  29.93 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 495 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 490 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.76 
 
 		 495 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.48 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  23.98 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  22.05 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>