45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1942 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 464 aa  857    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  47.81 
 
 		 456 aa  325  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  32.41 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  33.85 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  37.58 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.46 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.95 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 495 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  26.37 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  26.04 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  32.76 
 
 		 135 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  33 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>