98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1767 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
447 aa  886    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  45.31 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  74.42 
 
 
135 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 
441 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 
446 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
453 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  26.33 
 
 
435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  26.45 
 
 
435 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6268  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455573  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.21 
 
 
517 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
539 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  28.87 
 
 
496 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
461 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
498 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 
512 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  27.87 
 
 
495 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 
494 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.4 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 
430 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
489 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 
470 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  22.61 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
482 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.51 
 
 
458 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
455 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
460 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
490 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 
456 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
423 aa  60.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 
435 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
529 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
456 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.97 
 
 
490 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 
475 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
516 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  24.24 
 
 
517 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  22.08 
 
 
484 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
483 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  21.52 
 
 
495 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 
464 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  24.53 
 
 
519 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
514 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  24.53 
 
 
519 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  23.04 
 
 
520 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
515 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
500 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
475 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
539 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  32 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  32.57 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  32 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  28.85 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
413 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  28.85 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
490 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 
506 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  29.37 
 
 
480 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  24.06 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  24.83 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  18.9 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  24.47 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
488 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
456 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
474 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  23.86 
 
 
472 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
504 aa  43.1  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>