84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2947 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
484 aa  944    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  46.68 
 
 
479 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  45.4 
 
 
476 aa  344  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  36.47 
 
 
485 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 
470 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
475 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 
492 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.83 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 
504 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 
480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
477 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
481 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.14 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
477 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
444 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  29.79 
 
 
488 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 
483 aa  63.9  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 
509 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
475 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
511 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 
488 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 
463 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
489 aa  57  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
526 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 
539 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
546 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
472 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
499 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
426 aa  53.5  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
547 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.48 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1738  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
514 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.405975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.57 
 
 
464 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.35 
 
 
492 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 
495 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
512 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
505 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  25.23 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 
474 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
505 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
494 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
456 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 
466 aa  47  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  24.09 
 
 
467 aa  46.6  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
476 aa  47  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
476 aa  47  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 
500 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.05 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
135 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
434 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  21.09 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
517 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  24.46 
 
 
511 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
504 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
456 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  23.1 
 
 
467 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
500 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 
492 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>