76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1772 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 496 aa  988    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  45.04 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  42.27 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  40.9 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  39.83 
 
 		 461 aa  315  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  35.61 
 
 		 500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  39.64 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  41.34 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0489  polysaccharide biosynthesis-related protein  39.45 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 		 472 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  32.59 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0202  polysaccharide biosynthesis protein  32.49 
 
 		 538 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  29.72 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  30.79 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 507 aa  161  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 497 aa  156  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  30.2 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  25 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.1 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  25.97 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  20.9 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  23 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.9 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 489 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  28.64 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  22.12 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.25 
 
 		 517 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 483 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0498  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 512 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  22.4 
 
 		 360 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.43 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  19.87 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 481 aa  43.9  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 489 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>