48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0446 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  100 
 
 		 360 aa  711    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 482 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  24.79 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 465 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 476 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 500 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 496 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4624  hypothetical protein  27.89 
 
 		 471 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.68 
 
 		 508 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  27.54 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.96 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 520 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  24.08 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 489 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  24.08 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.08 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  24.08 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  24.08 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  24.08 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.08 
 
 		 459 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  25.61 
 
 		 517 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.38 
 
 		 508 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 504 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  23.67 
 
 		 459 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 500 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>