37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0196 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 471 aa  902    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 		 418 aa  95.9  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  27.04 
 
 		 430 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 474 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  31.84 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.44 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 479 aa  67  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3964  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  22.42 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.72 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 504 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 501 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0438  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1745  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.183747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 461 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  25.68 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  23.6 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  30.95 
 
 		 469 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 511 aa  43.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>