24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2100 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 415 aa  820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 490 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.52 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  19.41 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  19.41 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  19 
 
 		 483 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 465 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2834  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.675495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  27.16 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  21.36 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  28.37 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 471 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001771  O-antigen flippase Wzx  34.55 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>