12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2834 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2834  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 405 aa  785    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.675495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 477 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 487 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>