21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3026 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 406 aa  803    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1392  polysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  24.27 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2834  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.675495  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  20.76 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  25.37 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.96 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  26.69 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.96 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>