27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1425 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  100 
 
 		 469 aa  912    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.05 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.81 
 
 		 518 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  27.56 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  20.74 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 		 496 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4764  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 406 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>