79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0306 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 467 aa  928    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  48.31 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  48.16 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  49.03 
 
 		 483 aa  425  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  41.76 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  25.31 
 
 		 461 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0834  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00716427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.48 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.89 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.26 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3254  polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  23.68 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  25.71 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  24.91 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.45 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  21.13 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  26.29 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003537  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.61 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  20.28 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.9 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 482 aa  53.5  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0403  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.963909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 499 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 519 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  17.82 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  22.57 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0302  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.06 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  22.79 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0804  hypothetical protein  23.53 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.288732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0196  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0256028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1963  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.08 
 
 		 518 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.876605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 502 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0440  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.830934  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5446  polysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0406  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.260793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  23.53 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 463 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0336  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 504 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  21.02 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>