95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2481 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 477 aa  930    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  50.11 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  45.05 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  35.32 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  30.61 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  30.75 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  37.44 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4786  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.18 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5253  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.18 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5329  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.96 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2088  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  26.11 
 
 		 479 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2076  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.86 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0676  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  27.08 
 
 		 479 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.01 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4652  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  28.27 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541983  normal  0.0587271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.15 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  24.24 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1766  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.25 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.239762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  31.17 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  23.64 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0018  polysaccharide biosynthesis protein; permease component  28.93 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.54 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1772  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 		 490 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 482 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.96 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.81 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.44 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  19.08 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 479 aa  50.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 486 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  22.95 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.35 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  22.5 
 
 		 506 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  22.5 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4624  hypothetical protein  26.5 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.21 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  23.29 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  38.67 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  24.89 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0474  putative polysaccharide transporter protein  21.12 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  29.27 
 
 		 525 aa  43.5  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 519 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 444 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.86 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  33.54 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>