146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1311 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 477 aa  936    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  39.35 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  34.94 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  37.18 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  28.35 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 440 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  28.78 
 
 		 444 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 506 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 542 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  24.32 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  24.62 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  27.11 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4839  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261545  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3696  polysaccharide synthase family protein  25.07 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  20.25 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  23.89 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  25.44 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  27.72 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  25.8 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  21.21 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2128  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00415238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  21.73 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.21 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.48 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  22.59 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  22.31 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  24.5 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  22.58 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3265  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>