56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0629 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  100 
 
 		 467 aa  920    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  27.8 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  21.05 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  29.71 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.34 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  27.18 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 429 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  20.83 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 433 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 486 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 471 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.36 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  29.48 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 529 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  26.09 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.4 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  19.75 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  20.15 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  27.5 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>