124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3697 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 443 aa  866    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  54.63 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  54.96 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  30.9 
 
 		 419 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  32.55 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  29.32 
 
 		 417 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  28.54 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  27.61 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  28.54 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  27.61 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  27.61 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  28.54 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  28.54 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  27.61 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  32.03 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 477 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  26.34 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.87 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  21.96 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.76 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 429 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  24.2 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.78 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.34 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  20.89 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  20.29 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  20.29 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.29 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  24.01 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  19.43 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.79 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  21.89 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  24.43 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.79 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  17.65 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.52 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  24.04 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.8 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 500 aa  46.6  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  18.92 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  18.92 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  18.92 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>