79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1197 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  100 
 
 		 405 aa  794    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  32.93 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  29.24 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  31.06 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  30.47 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  31.98 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  26.87 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  26.87 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  26.87 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  26.87 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  26.87 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  26.87 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  26.87 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  26.12 
 
 		 422 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  28.52 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  25.9 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  29.77 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  26.12 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 485 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.51 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 486 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  25.69 
 
 		 481 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 474 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.16 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.43 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  20.65 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  22.58 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  24.1 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  24.1 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.74 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  22.38 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 483 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.65 
 
 		 484 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  24.77 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  24.77 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1112  O-antigen translocase  23.33 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0719133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 539 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  22.66 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>