59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1033 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
412 aa  792    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
415 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 
421 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  22.34 
 
 
422 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  20.62 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  20.62 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  20.62 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  20.62 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  20.62 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  20.62 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  20.62 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  19.26 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  25.49 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  19.95 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  20.87 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
429 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  23.3 
 
 
416 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 
430 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  19.17 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  18.6 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 
471 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
412 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 
485 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
406 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.24 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  18.41 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
486 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  18.01 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  21.03 
 
 
484 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 
429 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 
477 aa  46.6  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  18.36 
 
 
426 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
488 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
488 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
498 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
475 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  33.93 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
474 aa  43.5  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>