55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3729 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 438 aa  869    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  35.54 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  35.27 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 415 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  24.87 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.81 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  25.59 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.16 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  25.5 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  25.5 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  25.5 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  25.19 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  25.19 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  25.19 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  25.19 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  20.62 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  20.4 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  18.56 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  19.89 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  24.62 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  31.73 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  18.23 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  28.57 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 1103 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>