130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0604 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 483 aa  945    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  98.33 
 
 		 486 aa  927    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  64.73 
 
 		 483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  48.45 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  47.83 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  47.2 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  47.41 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  47.41 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  47.41 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  47.41 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.95 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  25.26 
 
 		 481 aa  158  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  24.12 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.43 
 
 		 484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  23.82 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  23.87 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  21.29 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 418 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.05 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  22.52 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  20.27 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.03 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  20.43 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  19.05 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  18.81 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  19.05 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  19.05 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  19.31 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  18.78 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  18.78 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  18.78 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  18.78 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  23.31 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  23.31 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  22.78 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  23.65 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  23.12 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 426 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.1 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  20.91 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.33 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.02 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 505 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 		 522 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  21.33 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  20.65 
 
 		 533 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  20.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.52 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  20.94 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>