29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2885 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
404 aa  797    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
409 aa  163  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.92 
 
 
484 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  25.12 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.43 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  21.98 
 
 
486 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 
483 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 
478 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
476 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
476 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.16 
 
 
471 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
471 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 
485 aa  59.7  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  22.19 
 
 
484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
484 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  22.19 
 
 
484 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
486 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  19.24 
 
 
484 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.76 
 
 
484 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  18.8 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  20.54 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>