32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2535 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 409 aa  814    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  24.04 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  24.04 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.82 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.41 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  23.31 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.57 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  19.93 
 
 		 484 aa  49.7  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.75 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  22.58 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>