91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5560 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 
484 aa  942    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  95.45 
 
 
484 aa  865    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  61.36 
 
 
484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  61.36 
 
 
484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  61.36 
 
 
484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  61.36 
 
 
484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  59.42 
 
 
484 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  47.83 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  47.69 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  46.68 
 
 
483 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.66 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  25.1 
 
 
475 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  27.75 
 
 
471 aa  137  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 
474 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 
485 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  26.67 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
486 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  26.57 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
471 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 
472 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
476 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
476 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.82 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.55 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  25 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  19.74 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
431 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
421 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
424 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  20.69 
 
 
444 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
429 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
406 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  22.8 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
430 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
488 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  25 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  25 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  24.52 
 
 
488 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 
419 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 
440 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  24.92 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.24 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  25.25 
 
 
488 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  24.92 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  24.92 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  23.23 
 
 
486 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
484 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
484 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  19.58 
 
 
419 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  20.1 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
492 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
488 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
488 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 
494 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  20.69 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  20.52 
 
 
422 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  20.52 
 
 
422 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  20.52 
 
 
422 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
498 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
461 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  19.67 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  20.26 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  20.26 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  20.26 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  20.26 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  20.86 
 
 
492 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.73 
 
 
490 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>