64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1073 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  71.25 
 
 
484 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 
488 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 
488 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  71.25 
 
 
484 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  79.27 
 
 
488 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  71.25 
 
 
484 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  71.46 
 
 
484 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  71.49 
 
 
488 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  71.46 
 
 
484 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  71.49 
 
 
488 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  71.49 
 
 
488 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 
488 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
492 aa  967    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  80.28 
 
 
488 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 
488 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 
488 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  71.14 
 
 
498 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  70.1 
 
 
488 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  55.49 
 
 
486 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  34.3 
 
 
478 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  32.79 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  32.79 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  36.6 
 
 
488 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  30.75 
 
 
473 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 
424 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 
422 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 
429 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 
419 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
468 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  25.78 
 
 
506 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 
504 aa  63.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
497 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.57 
 
 
501 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.29 
 
 
504 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.43 
 
 
507 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
519 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.66 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  24.22 
 
 
516 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
468 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  19.41 
 
 
504 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 
484 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
507 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 
477 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  24.6 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.91 
 
 
483 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
461 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  20.98 
 
 
511 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  21.71 
 
 
478 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 
471 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  22.78 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
550 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 
499 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
482 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
484 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 
448 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  36.25 
 
 
406 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>