62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0962 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  100 
 
 		 511 aa  1001    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 504 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 499 aa  97.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 499 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  20.51 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.71 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  19.88 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.75 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.14 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  21.55 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  21.27 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  21.27 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  21.27 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  21.27 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  21.27 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.65 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2367  membrane protein for polysaccharide transport  24.28 
 
 		 507 aa  54.3  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  20.66 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  20.84 
 
 		 525 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  24.02 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  19.24 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.45 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05840  hypothetical protein  24.16 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.405114  hitchhiker  0.000230137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  19.64 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  33.85 
 
 		 586 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  21.45 
 
 		 516 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 482 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.61 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  19.73 
 
 		 509 aa  43.5  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>