50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2211 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 494 aa  986    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  44.74 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  40.97 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  26.64 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 501 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.97 
 
 		 499 aa  97.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  20.83 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  20.53 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 473 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  23.65 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3931  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.849144  normal  0.0165624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 513 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  20.78 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  21.77 
 
 		 533 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 511 aa  50.8  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0117  polysaccharide transport protein, putative  24.46 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000854887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  22.32 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  22.32 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  22.32 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  22.32 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  22.32 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  20.08 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  20.78 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  32.47 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  17.81 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2896  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 482 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 591 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>