27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0311 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 418 aa  829    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  35.18 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 457 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 448 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4456  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3186  LPS side chain defect: putative O-antigen transferase  22.12 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.15241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 501 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  23.05 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  23.04 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  23.13 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  22.71 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3391  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273655  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  32.43 
 
 		 520 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>