37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3669 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 501 aa  993    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.64 
 
 		 507 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 504 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  26.01 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 513 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 499 aa  94.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  24.04 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  25.87 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  22.34 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1572  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 583 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 		 468 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  22.94 
 
 		 522 aa  53.5  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 504 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  23.42 
 
 		 938 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0636  putative flippase  25.74 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.765115 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 		 591 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>