210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1424 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  100 
 
 		 938 aa  1825    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 467 aa  201  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 467 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  36.05 
 
 		 467 aa  195  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 467 aa  184  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  34.89 
 
 		 475 aa  183  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 575 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 575 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 538 aa  180  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 545 aa  172  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  30.72 
 
 		 549 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 556 aa  171  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  30.69 
 
 		 547 aa  167  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 554 aa  166  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 583 aa  165  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  31.97 
 
 		 558 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 586 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 545 aa  164  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  30.72 
 
 		 553 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 553 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  30.87 
 
 		 586 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 552 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  31.15 
 
 		 591 aa  157  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 553 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 456 aa  156  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 545 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 553 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 553 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 455 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 550 aa  151  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  34.17 
 
 		 507 aa  148  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 553 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  30.39 
 
 		 551 aa  146  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 518 aa  143  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 549 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 448 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 463 aa  142  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 411 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 464 aa  139  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 464 aa  136  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 566 aa  135  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 546 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 556 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 537 aa  132  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 433 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 		 413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  28.39 
 
 		 552 aa  127  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 412 aa  127  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 552 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 397 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 552 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 418 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 570 aa  112  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 		 424 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  27.83 
 
 		 401 aa  104  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  26.82 
 
 		 406 aa  101  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 421 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 424 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 415 aa  98.6  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 424 aa  97.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 442 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 434 aa  95.1  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  29.97 
 
 		 455 aa  91.3  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 425 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 453 aa  87.8  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 400 aa  86.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  23.99 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.99 
 
 		 400 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  23.99 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  23.99 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.19 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  23.66 
 
 		 402 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 454 aa  84  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  23.66 
 
 		 402 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 402 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 405 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.62 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.36 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  23.22 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 400 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  23.7 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  22.77 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  23.5 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.35 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.35 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  24.8 
 
 		 400 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  23.76 
 
 		 400 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  23.76 
 
 		 400 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  24.8 
 
 		 400 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>